“黑箱”监狱作为联盟最大的重刑犯监狱，专门关押各路重刑犯和危险犯人。监狱分成两个大区，一个是监禁区，剩下的为活动区。整座监狱位于山体内部，仅有一个进出口，且出入口处有重兵把守，出入需要严密的手续和审查。其中对于囚犯分为四个等级，且对不同等级的囚犯进行不同的处理和改造措施。

一级女囚：在一众重刑犯中属于危险性最小，破坏力最小，相对来说最乖巧的囚犯。标准戒具是钢制手铐，同样为钢制的脚镣，在休息时不佩戴戒具，在劳动时不佩戴手铐。一级女囚不需要进行排泄管理和性欲管理，所以不需要佩戴无菌材料制成的贞操带，仅需要穿戴普通囚服即可，且受惩戒时不需要裸体。

二级女囚：比一级女囚更为顽固，坚韧，在众多重刑犯中仍然属于乖巧的一类。标准戒具与一级女囚一致，但在休息时需要佩戴脚镣，在劳作时不能解除戒具。且需要进行性欲管理，将穿戴无菌材料制成的永久性贞操带，但贞操带上不安装肛塞和尿道锁，只需要安装一个尺寸贴合该女囚阴道长度的假阳具，假阳具可以进行震动和放电，且能够精准的控制穿戴者的高潮进度。另外，二级女囚每个月都需要进行例行惩戒，惩戒过程中不需要全裸。

三级女囚：顽固不化的典型，反抗精神高昂，时不时地会出现对抗看守的行为。佩戴更为沉重的戒具，且手铐与脚镣相连接，任何时候都不能解除戒具，除非看守要求或许可。需要进行排泄管理和性欲管理，贞操带上将安装可以震动、放电以及其他惩戒功能的肛塞、假阳具以及尿道锁，使女囚仅能在规定的时间之内进行排泄。三级女囚每周都需要接受惩戒，惩戒过程将向全设施所有人员直播，在惩戒过程中必须保持全裸。

四级女囚：顽固到已经无法挽救和改造，其作为人类的身份已经被抹去，不能假释、减刑，不参与任何劳动过程，但需要为自己犯下的过错赎罪，即每年都进行生育。并将在5-10年后进行完全洗脑，进行性偶化处理，向公众开放购买。

除此之外，还有死刑犯。死刑犯将穿戴乳胶制的拘束衣，双臂将被固定在胸前，双腿只能以小碎步的形式进行慢速移动。将安装相应的排泄管理与性欲管理用具，且死刑女囚只能通过灌肠的形式进行排泄。除死刑立即执行的女囚以外，其他死刑女囚将按照此规格关押5-15天，等待最后的复核。

为了使女囚能更好的接受改造和调教，该监狱特别设立“管理者制度”，即安排专人作为管理者对女囚进行调教和管理，每名管理者可以管理五名一级女囚、三名二级女囚和一名三级女囚。四级女囚由于已经无药可救，仅安排1-3名播种者对其进行授精和惩戒。死刑犯不配备管理者，但如果该死刑犯是由一至三级女囚转变而来，将由该女囚的管理者将其处刑。

“黑箱”监狱还有一套奖惩机制，每年年底将对所有女囚进行评估，并将评估结果提交给联盟法院以及监狱管理层，以此决定该女囚的命运。联盟监狱会根据评估结果对女囚进行减刑、延长刑期等奖励或惩罚措施，而监狱管理层将根据评估结果变更女囚的等级。

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